蛋鸡下软壳蛋的原因有很多，常见的是营养方面的问题。比如饲喂日粮中缺少钙和磷，饲料中钙和磷的比例失调。蛋壳形成需要大量的钙，产蛋鸡缺钙会直接导致蛋鸡产薄壳、软壳蛋。
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一般来说，产蛋鸡日粮中钙和有效磷的量一般为1%和0.5%。维生素D可以促进钙、磷的吸收，利于蛋壳的形成，如果维生素D缺乏，即使饲料中钙磷含量充足，也同样会导致蛋鸡产薄壳、软壳蛋。
蛋鸡最适宜的温度是13～25℃，同时还要保持良好的通风情况。而应激也会影响蛋鸡产蛋性能，要保持鸡舍环节相对平稳安静。
此外，光照不足也会影响钙的吸收，对蛋壳形成也有一定的影响。最后，则可能是蛋鸡本身的问题。比如老龄蛋鸡，产薄壳蛋和软壳蛋的概率也较大。